Była solistką baletu w Teatrze Wielkim w Łodzi (1985 -1993 tancerka i solistka baletu w Teatrze Wielkim w Łodzi). Partie w baletach: "Królewna Śnieżka i siedmiu krasnoludków" , "Don Kichot" choreografia W. Borkowski, "Sen nocy letniej", "Romeo i Julia", "Amadeus" chor. G.Veredon, "Faust Goes Rock" chor. E.Wycichowska, "Legenda o Józefie" chor. E. Wesołowski, "Otello" chor. Cz. Bilski

Od 1993 do 2006 r. solistka baletu, Teatr Wielki – Opera Narodowa. Znaczące role w baletach: Święto Wiosny, Harnasie, Powracające fale, Cudowny Mandaryn choreografia E. Wesołowski, Bolero - chor A. Fodor, Panna Julia - chor. B.Cullberg, Fortepianissimo, Grek Zorba - chor. L.Massine, Alpha Kryonia Xe, III symfonia - Pieśń o nocy, - chor. J. Przybyłowicz

W latach 2009- 2014 baletmistrz, asystent choreografa - Teatr Wielki w Poznaniu. Od 2014 do 2020 roku baletmistrz, asystent choreografa, koordynator pracy baletu w Narodowym Teatrze Morawskośląskim w Ostrawie (Czechy)

Asystent i korepetytor spektakli baletowych w Narodowym Teatrze Morawsko-śląskim w Ostrawie:
Małgorzata Chojnacka współpracowała jako pedagog i asystent reżysera z Operą Bałtycką w Gdańsku,  Operą Nova w Bydgoszczy, Operą na Zamku w Szczecinie, Operą Wrocławską,
Łotewskim Teatrem Narodowym Opery i Baletu w Rydze, oraz Morawskim Teatrem w Olmouc,

Od 2004 do 2019 była wykładowcą na kierunku Kształcenie muzyczno- ruchowe w Akademii Pedagogiki Specjalnej im M. Grzegorzewskiej w Warszawie 

Czym jest dla Małgorzaty Chojnackiej prowadzenie baletu Opery Nova?